Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Prpf40a-208ENSMUST00000210789 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Sept2-213ENSMUST00000168776 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Pnmal1-201ENSMUST00000038163 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Ggt5-201ENSMUST00000072217 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Atp2a1-201ENSMUST00000032974 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Ube4bos1-201ENSMUST00000141259 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Nup98-203ENSMUST00000210682 6694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms