Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Ccnc-201ENSMUST00000065928 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Stk36-202ENSMUST00000087186 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Glipr1l2-202ENSMUST00000148897 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm16350-201ENSMUST00000162958 446 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 2610105M22Rik-201ENSMUST00000193707 1153 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm7682-202ENSMUST00000202916 1582 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Ufl1-202ENSMUST00000102994 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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