Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Mrpl55-201ENSMUST00000045697 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Rpl32-201ENSMUST00000081840 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Mir212-201ENSMUST00000083656 91 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Sat2-201ENSMUST00000092969 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Olfr1239-201ENSMUST00000099780 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Sertad4-201ENSMUST00000016406 3090 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 BC025920-204ENSMUST00000121138 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Trak2-205ENSMUST00000174120 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Cinp-202ENSMUST00000220607 1579 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Scml2-204ENSMUST00000087090 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 D630039A03Rik-201ENSMUST00000063816 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Tmem175-203ENSMUST00000120327 1811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Chrdl2-202ENSMUST00000107084 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Sfmbt2-203ENSMUST00000114862 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Foxp3-202ENSMUST00000115738 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Zfp383-201ENSMUST00000186475 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Ctss-202ENSMUST00000116304 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm3519-201ENSMUST00000196113 1676 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Crp-201ENSMUST00000038495 1695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Def8-202ENSMUST00000065534 3127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Fanci-202ENSMUST00000118959 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm17304-201ENSMUST00000167618 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Kank3-204ENSMUST00000173789 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Igkv4-62-201ENSMUST00000177795 288 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm28244-201ENSMUST00000189342 356 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm7893-201ENSMUST00000189666 225 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Krtap14-202ENSMUST00000189774 856 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm10522-201ENSMUST00000194503 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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