Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo3Q8C2S7 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Ece2-207ENSMUST00000079600 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Amigo3Q8C2S7 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Amigo3Q8C2S7 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Amigo3Q8C2S7 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Amigo3Q8C2S7 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Stmn2-201ENSMUST00000029002 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Amigo3Q8C2S7 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm8540-201ENSMUST00000168952 732 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Amigo3Q8C2S7 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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