Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms