Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms