Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 AC123069.1-201ENSMUST00000215094 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gpr85-203ENSMUST00000115492 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Tbx19-201ENSMUST00000027859 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Serpina3f-201ENSMUST00000101080 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Nup98-203ENSMUST00000210682 6694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Eny2-201ENSMUST00000060652 3000 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Cd36-201ENSMUST00000082367 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Zfp677-202ENSMUST00000162659 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm45515-201ENSMUST00000210796 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Arpp21-230ENSMUST00000172380 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Srp72-201ENSMUST00000101087 3625 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Atp6ap2-201ENSMUST00000033313 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ogdhl-201ENSMUST00000022480 3449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 March7-201ENSMUST00000067542 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Brd8-204ENSMUST00000115766 4258 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm12055-201ENSMUST00000143643 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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TsksO54887 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Zfp180-202ENSMUST00000203854 3845 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Olfr117-203ENSMUST00000215414 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TsksO54887 Hist2h2be-201ENSMUST00000090781 2620 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TsksO54887 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TsksO54887 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TsksO54887 Prox2-201ENSMUST00000110249 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TsksO54887 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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