Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm10556-201ENSMUST00000180904 3906 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Def8-204ENSMUST00000108830 3191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccdc18Q640L5 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccdc18Q640L5 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccdc18Q640L5 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccdc18Q640L5 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Tmem175-202ENSMUST00000078323 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccdc18Q640L5 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccdc18Q640L5 Top3a-202ENSMUST00000102668 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc18Q640L5 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc18Q640L5 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc18Q640L5 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc18Q640L5 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc18Q640L5 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc18Q640L5 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms