Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms