Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm7577-201ENSMUST00000182543 982 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm23927-202ENSMUST00000199928 216 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm18114-201ENSMUST00000221780 523 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Rpl21-ps3-201ENSMUST00000080223 483 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Clnk-201ENSMUST00000169819 1700 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Clnk-202ENSMUST00000171633 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Crem-209ENSMUST00000129435 1160 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm12708-202ENSMUST00000136941 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Fhad1os1-201ENSMUST00000146094 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm25767-201ENSMUST00000158572 124 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm23823-201ENSMUST00000158740 124 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm17053-201ENSMUST00000163501 495 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm22461-201ENSMUST00000175272 70 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm8689-201ENSMUST00000218709 712 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm4257-201ENSMUST00000222877 513 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm6505-201ENSMUST00000094335 648 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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