Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
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OtofQ9ESF1 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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OtofQ9ESF1 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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