Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ighv14-2-201ENSMUST00000103467 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm7645-201ENSMUST00000119008 788 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 4930579G18Rik-201ENSMUST00000167763 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm8479-202ENSMUST00000204366 1070 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm7476-201ENSMUST00000220112 661 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm40578-202ENSMUST00000221429 920 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr24-201ENSMUST00000066997 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr96-201ENSMUST00000078209 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Rpl7a-ps8-201ENSMUST00000094754 801 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm16026-201ENSMUST00000094774 580 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Raet1d-202ENSMUST00000182677 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam1-202ENSMUST00000098668 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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