Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Use1Q9CQ56 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Use1Q9CQ56 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Use1Q9CQ56 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Use1Q9CQ56 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Use1Q9CQ56 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Use1Q9CQ56 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Use1Q9CQ56 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Use1Q9CQ56 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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