Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rb1cc1Q9ESK9 Srgap1-202ENSMUST00000081688 7787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rb1cc1Q9ESK9 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rb1cc1Q9ESK9 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Slc11a2-205ENSMUST00000138843 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rb1cc1Q9ESK9 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 1810014B01Rik-205ENSMUST00000218691 323 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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