Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 4930473H19Rik-202ENSMUST00000222124 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 AC123058.1-201ENSMUST00000223748 437 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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TtrP07309 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 Defa28-201ENSMUST00000098887 400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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TtrP07309 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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TtrP07309 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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TtrP07309 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TtrP07309 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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TtrP07309 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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TtrP07309 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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TtrP07309 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TtrP07309 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Grip1-204ENSMUST00000105261 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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TtrP07309 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 4921515L22Rik-201ENSMUST00000218993 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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