Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Letm1Q9Z2I0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Letm1Q9Z2I0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms