Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms