Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Arid3bQ9Z1N7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid3bQ9Z1N7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms