Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Hmg20bQ9Z104 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hmg20bQ9Z104 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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