Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms