Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms