Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn15Q9Z0S5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms