Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn1Q9Z0I7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn1Q9Z0I7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms