Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Extl3Q9WVL6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Extl3Q9WVL6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl3Q9WVL6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl3Q9WVL6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl3Q9WVL6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl3Q9WVL6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl3Q9WVL6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl3Q9WVL6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl3Q9WVL6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl3Q9WVL6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Extl3Q9WVL6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms