Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx1Q9WV80 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx1Q9WV80 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx1Q9WV80 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx1Q9WV80 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx1Q9WV80 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx1Q9WV80 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx1Q9WV80 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx1Q9WV80 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx1Q9WV80 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx1Q9WV80 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx1Q9WV80 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms