Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU02

Avpr1b, Vasopressin V1b receptor, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avpr1bQ9WU02 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avpr1bQ9WU02 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Avpr1bQ9WU02 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avpr1bQ9WU02 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avpr1bQ9WU02 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avpr1bQ9WU02 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms