Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkraQ9WTX2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkraQ9WTX2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms