Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma4Q9R1P0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms