Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms