Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms