Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phtf1Q9QZ09 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms