Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphp1Q9QY53 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms