Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ChmQ9QXG2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms