Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms