Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tcea2Q9QVN7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms