Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma6Q9QUM9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms