Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl3Q9JMG7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms