Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms