Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh9a1Q9JLJ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms