Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ldb3Q9JKS4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms