Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms