Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms