Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms