Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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