Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnmb4Q9JIN6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnmb4Q9JIN6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnmb4Q9JIN6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnmb4Q9JIN6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnmb4Q9JIN6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms