Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms