Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb3Q9ERD7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb3Q9ERD7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms