Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfcp2Q9ERA0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfcp2Q9ERA0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms