Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms