Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clstn2Q9ER65 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms